Gigabyte выпускает..

Компания Gigabyte объявила о выпуске новой компактной видеокарты GTX 970, которая получила номер..


» » МФТИ и МГУ разработали для агрохимии компьютерную модель, предсказывающую активность молекул


МФТИ и МГУ разработали для агрохимии компьютерную модель, предсказывающую активность молекул


18-02-2016, 20:45 Новости » МФТИ и МГУ разработали для агрохимии компьютерную модель, предсказывающую активность молекул


Для построения модели авторы применили методы машинного обучения, в частности — cамоорганизующиеся карты Кохонена


МФТИ и МГУ разработали для агрохимии компьютерную модель, предсказывающую активность молекул

© Дмитрий Феоктистов/ТАСС

МОСКВА, 16 февраля. /Корр. ТАСС Александра Борисова/. Ученые из МФТИ и МГУ под руководством Яна Иваненкова впервые разработали компьютерную модель, позволяющую предсказывать агрохимическую активность — наличие полезного воздействия на растения — простых молекул. С использованием независимого тестового набора и результатов собственного исследования было показано, что модель обладает высокой предсказательной способностью. Работа опубликована

МФТИ и МГУ разработали для агрохимии компьютерную модель, предсказывающую активность молекул

Построенная модель Кохонена: зеленый градиент на заднем фоне соответствует молекулам — активаторам роста растений из обучающей выборки, более темные области заселены большим количеством молекул. Кружками показаны молекулы из тестового (экспериментального) набора. Видно, что большинство протестированных молекул лежит в темных областях, что свидетельствует о высокой предсказательной способности модели.

Построенная модель Кохонена: зеленый градиент на заднем фоне соответствует молекулам — активаторам роста растений из обучающей выборки, более темные области заселены большим количеством молекул. Кружками показаны молекулы из тестового (экспериментального) набора. Видно, что большинство протестированных молекул лежит в темных областях, что свидетельствует о высокой предсказательной способности модели.

© Bushkov et. al./Phytochemistry

«

МФТИ и МГУ разработали для агрохимии компьютерную модель, предсказывающую активность молекул

Дибензазепин — регулятор роста растений, одна из молекул, правильно классифицированная моделью

Дибензазепин — регулятор роста растений, одна из молекул, правильно классифицированная моделью

© Bushkov et. al./Phytochemistry

С использованием алгоритма Кохонена без учителя можно уменьшить размерность этих данных с наименьшей ошибкой (этот этап назвается обучением алгоритма) и визуализировать результат в виде удобной для анализа двумерной карты, на которой можно поочередно выделить области, занимаемые молекулами из различных категорий. Тогда по этой карте можно оценить классификационную способность модели. Если эта способность в высока (например, для подобных масштабных задач это больше 70%), то модель можно протестировать с использованием независимого тестового набора молекул, которые не принимали участие в обучении. Именно это и сделали авторы работы, наглядно продемонстрировав, что их модель способна прогнозировать специфическую активность новых молекул, относя их к одной из общепринятых категорий: гербициды, регуляторы роста растений и т.п.

В будущем подобные вычислительные модели позволят значительно удешевить поиск новых активных молекул и внесут свой вклад в понимание механизмов их действия.







Также читайте: 

Похожие новости
Уважаемый посетитель, Вы зашли на сайт как незарегистрированный пользователь. Мы рекомендуем Вам зарегистрироваться либо войти на сайт под своим именем.
Информация
Посетители, находящиеся в группе Гости, не могут оставлять комментарии к данной публикации.